Bernhard Röthlisberger hat Bassklarinette bei Thomas Friedli, Antony Pay, Michel Arrignon, Ernesto Molinari studiert. Von 1993 bis 2010 war er Mitglied des Luzerner Sinfonieorchesters, seither ist er Soloklarinettist und Bassklarinettist des Berner Symphonieorchesters. Als Solist trat er mit international renommierten Dirigenten wie Jonathan Nott, Reinhard Goebel, Vasily Petrenko, John Neschling oder Mario Venzago auf. Er ist regelmässiger Gastkünstler an Festivals und Dozent von Meisterkursen in ganz Europa. Er hat zahlreiche CD-Produktionen bei GALLO, pan classics und Musiques Suisses. Er unterrichtet Bassklarinette und Orchesterstudien an den Musikhochschulen Zürich und Bern.
Bernhard Röthlisberger ist Gründer und war bis 2023 künstlerischer Leiter der Internationalen Meisterkurse und der Sommerserenaden Rheinau.